莎車(chē)遠(yuǎn)在西周成王誦時(shí)期就已開(kāi)始與中原保持聯(lián)系，曾進(jìn)獻(xiàn)白玉、野馬等物。

　　漢武帝曾兩次派張騫出使西域，都途經(jīng)莎車(chē)等地。漢元康元年（前65）,宣帝劉詢(xún)應(yīng)莎車(chē)國(guó)使節(jié)之求，遣使者奚充國(guó)送解憂(yōu)公主（嫁烏孫王）之子萬(wàn)年出任莎車(chē)王，莎車(chē)歸屬漢朝。漢神爵二年（前60）,漢朝在烏壘設(shè)西域都護(hù)府，莎車(chē)受其管轄。東漢建武五年（29）,漢遣河西大將軍竇融承制封莎車(chē)王康為建功懷德王、西域大都尉。東漢永平車(chē)年（61）,莎車(chē)被于闐兼并。其后，匈奴又將莎車(chē)王賢的質(zhì)子不居徵立為莎車(chē)王。永平十六年（73）假司馬班超與從事郭恂使西域，其時(shí)于闐王廣德，又攻殺不居徵，立其弟齊黎為莎車(chē)王，莎車(chē)時(shí)順時(shí)叛漢朝。班超發(fā)于闐等國(guó)兵擊敗莎車(chē)。漢永元三年（96）,漢復(fù)立西域都護(hù)，莎車(chē)受其管轄為。永初元年（107）六月，漢罷西域都護(hù)府，莎車(chē)又役屬匈奴。

　　魏黃初二年（221）,設(shè)西域戊已校尉，莎車(chē)歸魏。晉泰始元年（265）,晉代魏立，仍置西域戊已校尉，莎車(chē)歸晉。晉咸 康二年（336）,西域盡入前涼版圖，今縣境受其管轄。晉太元九年（384）,前秦將軍呂光征龜茲獲勝，今莎車(chē)一帶使節(jié)隨鄯善王比龍入朝，向?qū)幏Q(chēng)臣貢獻(xiàn)。北魏太延元年（435）西域諸國(guó)相繼朝貢于魏，《魏書(shū)》稱(chēng)渠沙國(guó)為故莎車(chē)城。北魏和平元年（460）,柔然汗國(guó)占據(jù)天山一帶，今縣境屬柔然勢(shì)力工范圍。高昌沮渠余眾的一部分奔莎車(chē)，沮渠被譯作“朱居波”、“悉居半”、“遮拘迦”等，今莎車(chē)一帶在朱居波屬高車(chē)的勢(shì)力范圍，北魏太和二十一年（497），吠噠占據(jù)天山南路，朱居波受吠噠統(tǒng)治。北周保定二年（562）,突厥與波斯聯(lián)合擊敗吠噠，突厥勢(shì)力進(jìn)入今縣境。

　　隋仁壽三年（603）,突厥汗國(guó)正式分裂為東西兩個(gè)汗國(guó)，今縣境受西突厥統(tǒng)轄。

　　唐貞觀(guān)二十一年二十二年（647～648）,唐伐龜茲，葉蕃發(fā)兵助戰(zhàn)，其勢(shì)力一度進(jìn)入昆侖山北麓今莎車(chē)一帶。唐顯慶四年（659）,唐朱居波等地置州、府、縣。唐咸亨元年（670）,吐蕃陷安西四鎮(zhèn)，今縣境為吐蕃占有。唐咸亨四年（673）,長(zhǎng)史蕭嗣業(yè)統(tǒng)東突厥部西征，重新控制蔥嶺以東，今莎車(chē)一帶又歸唐朝管理。唐天寶十四載（755）,“安史之亂”后，唐在西域的駐軍被調(diào)往內(nèi)地，吐蕃乘機(jī)奪取河瀧之地。至8世紀(jì)90年代初，南疆地區(qū)全部落入吐蕃之手，縣境一帶為吐蕃轄地。9世紀(jì)末，今莎車(chē)境屬喀拉汗朝。

　　宋太祖開(kāi)寶三年（971）,今縣境一帶在西方文獻(xiàn)中被稱(chēng)為鴨兒看，后譯為葉爾羌。宋建炎二年（1128），今莎車(chē)一帶屬西遼，宋嘉定十一年（1218）屬蒙古汗國(guó)。蒙古太祖二十年（1225）,成吉思汗將其領(lǐng)地分封諸子，鴨兒看，在察合臺(tái)汗封地之內(nèi)。元至元十一年（1274）,元世祖忽必烈下詔安撫鴨兒看。元大德六年（1320）葉爾羌東察合臺(tái)汗國(guó)。

　　明正德九年（1514）,莎車(chē)古城為薩亦德建立的葉爾羌汗國(guó)國(guó)都，莎車(chē)城成為葉爾羌汗國(guó)的政治、經(jīng)濟(jì)、文化中心。清康熙十七年（1678）,葉爾羌?xì)w屬準(zhǔn)噶爾汗國(guó)。乾隆二十四年（1759）,清政府平定大小和卓之亂后，定邊將軍和參贊大臣駐扎葉爾羌城處理新疆軍政大事。其后設(shè)辦事大臣、參贊大臣。清光緒二十八年（1902）,莎車(chē)直隸州升為府，所置皮山縣、蒲犁廳（今塔什庫(kù)爾干縣）屬莎車(chē)府管轄。

　　民國(guó)初年仍沿襲清末舊制，民國(guó)2年（1913）撤府設(shè)縣，設(shè)立莎車(chē)縣，仍由喀什噶爾道轄。民國(guó)17年（1928）,莎車(chē)劃為莎車(chē)、葉爾羌兩縣。民國(guó)31年（1942），新疆省府決定將兩縣合并，在莎車(chē)設(shè)第十區(qū)行政長(zhǎng)官公署，后改為莎車(chē)行政督察專(zhuān)員公署，轄莎車(chē)、澤普、葉城、麥蓋提4縣。直至1949年9月25日新疆和平解放，莎車(chē)一直為專(zhuān)署所在地。

　　1956年4月21日，莎車(chē)專(zhuān)署撤銷(xiāo)，莎車(chē)縣隸屬喀什專(zhuān)區(qū)。